MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium saccharolyticum WM1 chromosome

Total Repeats: 14102

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014376	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014376	CTA	3	9	1637	1645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014376	ACG	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014376	TAT	2	6	1665	1670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014376	CAA	2	6	1709	1714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014376	GA	3	6	2856	2861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014376	GA	3	6	2868	2873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014376	AG	3	6	2920	2925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014376	AGG	2	6	4350	4355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014376	GGA	2	6	6284	6289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014376	T	7	7	9007	9013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014376	CCT	2	6	10965	10970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014376	CCA	2	6	11004	11009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_014376	TGG	2	6	11039	11044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014376	A	6	6	11057	11062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014376	AATG	2	8	11068	11075	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014376	AAT	2	6	11094	11099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014376	AGG	2	6	11170	11175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014376	AGG	3	9	11498	11506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014376	TAA	2	6	12775	12780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014376	AGG	2	6	14608	14613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014376	AG	3	6	14977	14982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014376	CCG	2	6	15027	15032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_014376	T	7	7	15517	15523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014376	TGC	2	6	15538	15543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014376	AAAT	2	8	15547	15554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014376	TAA	2	6	15599	15604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014376	AAAT	2	8	15618	15625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014376	ATG	2	6	15677	15682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014376	GGA	2	6	15710	15715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014376	AT	3	6	17872	17877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014376	ATT	2	6	18051	18056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014376	T	6	6	18055	18060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014376	A	6	6	18075	18080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014376	CTA	2	6	18107	18112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014376	TA	3	6	18111	18116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014376	A	6	6	18136	18141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014376	TAAAA	2	10	18142	18151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014376	A	7	7	18148	18154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014376	ACAGA	2	10	18161	18170	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014376	AAGA	2	8	18202	18209	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014376	ACA	2	6	18210	18215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014376	AGA	2	6	18233	18238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014376	TAA	2	6	18268	18273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014376	ACA	2	6	18344	18349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014376	AAAT	2	8	18361	18368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014376	TAGT	2	8	18373	18380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014376	A	6	6	18484	18489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014376	AAGC	2	8	18500	18507	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014376	GGC	2	6	18597	18602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014376	GCG	2	6	18672	18677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014376	GCT	2	6	18736	18741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014376	TGC	2	6	18762	18767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014376	GGT	2	6	18790	18795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014376	CCA	2	6	18841	18846	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014376	CGA	2	6	18850	18855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014376	GCA	2	6	18924	18929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014376	CGC	2	6	18971	18976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014376	GTGA	2	8	18977	18984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014376	CAG	2	6	19013	19018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014376	GAA	2	6	19020	19025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014376	AAG	2	6	19043	19048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014376	CAG	2	6	19067	19072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014376	AGG	2	6	19257	19262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014376	GGC	2	6	19278	19283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014376	GCC	2	6	19403	19408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_014376	GAA	2	6	19521	19526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014376	CCTTC	2	10	19570	19579	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_014376	GGT	2	6	19595	19600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014376	GTC	2	6	19609	19614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014376	TCGTG	2	10	19618	19627	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014376	TAG	2	6	19670	19675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014376	CAG	2	6	19677	19682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014376	GGA	2	6	19722	19727	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014376	ATC	2	6	19746	19751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014376	AC	3	6	19773	19778	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014376	AC	3	6	19942	19947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014376	AGG	2	6	20001	20006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014376	CCT	2	6	20083	20088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014376	GAA	3	9	20096	20104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014376	AAT	2	6	20197	20202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014376	A	6	6	20240	20245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014376	AAGC	2	8	20256	20263	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014376	GGTG	2	8	20423	20430	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014376	A	8	8	20442	20449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014376	TA	3	6	20468	20473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014376	CAG	2	6	20541	20546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014376	TA	3	6	20560	20565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014376	TGAGTT	2	12	20588	20599	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014376	AT	3	6	20719	20724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014376	CAAA	2	8	20799	20806	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014376	ACCCGC	2	12	20887	20898	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_014376	TAA	2	6	20923	20928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014376	GAG	2	6	20997	21002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014376	GGA	2	6	21125	21130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014376	AAAG	2	8	21131	21138	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014376	GCG	2	6	21159	21164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014376	AAG	2	6	21220	21225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014376	G	6	6	21355	21360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014376	ACC	2	6	21361	21366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_014376	C	6	6	21365	21370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_014376	TAC	2	6	21380	21385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014376	GGGAG	2	10	21436	21445	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014376	GGA	2	6	21676	21681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014376	GAT	2	6	21877	21882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014376	ACC	2	6	21939	21944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014376	AGC	2	6	22019	22024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014376	CA	3	6	22025	22030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014376	ATGT	2	8	22115	22122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014376	AAG	2	6	22188	22193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014376	AG	3	6	22192	22197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014376	TCC	2	6	22232	22237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014376	ACA	2	6	22326	22331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014376	ATC	2	6	22354	22359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014376	GAA	2	6	22385	22390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014376	TG	3	6	22523	22528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014376	CCGTA	2	10	22537	22546	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014376	GAG	2	6	22564	22569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014376	CGG	2	6	22583	22588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014376	GAG	2	6	22764	22769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014376	CGG	2	6	22813	22818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014376	ACC	2	6	23084	23089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014376	CTGG	2	8	23125	23132	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014376	GGT	2	6	23307	23312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014376	GTA	2	6	23440	23445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014376	CGT	2	6	23502	23507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014376	GAG	2	6	23551	23556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014376	C	6	6	23677	23682	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
129	NC_014376	GAC	2	6	23724	23729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014376	GGTT	2	8	23805	23812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014376	TG	3	6	23854	23859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014376	GCC	2	6	23920	23925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014376	CGG	2	6	23932	23937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014376	GAA	2	6	24090	24095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014376	AGC	2	6	24122	24127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014376	CAG	2	6	24139	24144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014376	ATC	2	6	24163	24168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014376	TAA	2	6	24183	24188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014376	ATGG	2	8	24192	24199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014376	TCCATC	2	12	24262	24273	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014376	ATATA	2	10	24303	24312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014376	TCG	2	6	24346	24351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014376	T	8	8	24396	24403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014376	GGT	2	6	24534	24539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014376	ATG	2	6	24647	24652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014376	ATTAT	2	10	24951	24960	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014376	A	6	6	24972	24977	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014376	A	8	8	25021	25028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014376	AAAGG	2	10	25068	25077	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014376	ATGA	2	8	26566	26573	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014376	ATG	2	6	26599	26604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014376	A	6	6	26629	26634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014376	AGGA	2	8	26715	26722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014376	A	6	6	26747	26752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014376	A	6	6	26807	26812	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014376	ATA	2	6	26851	26856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014376	A	6	6	26893	26898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014376	AAT	2	6	26904	26909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_014376	AATG	2	8	31141	31148	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014376	TGTT	2	8	31154	31161	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014376	A	6	6	31246	31251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014376	TTA	2	6	31255	31260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014376	T	6	6	31277	31282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014376	TCC	2	6	33786	33791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
166	NC_014376	ATT	2	6	35523	35528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014376	CTT	2	6	35576	35581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_014376	ACA	2	6	35660	35665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_014376	T	7	7	38313	38319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014376	GGA	2	6	38373	38378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014376	A	6	6	39359	39364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014376	GAAA	2	8	42528	42535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014376	ATG	2	6	42600	42605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_014376	GA	3	6	43487	43492	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014376	AG	3	6	45242	45247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014376	CT	3	6	45263	45268	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
179	NC_014376	AGG	2	6	45278	45283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_014376	T	6	6	51412	51417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014376	ATA	3	9	51418	51426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014376	GTT	2	6	51452	51457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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283	NC_014376	TAT	2	6	89416	89421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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